La mayor parte de los materiales rocosos que integran la sucesión estratigráfica descrita en el apartado «Materiales aflorantes», y ya hemos hecho referencias indirectas a ello, no conservan el dispositivo horizontal que adquirieron durante su sedimentación en la cuenca ibérica, a lo largo del Mesozoico y de la práctica totalidad del Terciario. Por el contrario, se hallan afectados por una serie de complejas deformaciones de plegamiento y de fractura, vinculadas a la tectónica alpina, que es la causante de la configuración estructural actual (mapa geológico anexo).
Dentro del término municipal de Molinos pueden diferenciarse tres conjuntos estructurales distintos, perfectamente individualizados, que de Norte a Sur son (fig. 9 y fig. 10): la alineación anticlinal de La Loma Gorda-Cantalobos, la cubeta terciaria del río Guadalopillo y las estructuras cabalgantes de Molinos, descritas en el menu de la izquierda.